Num relance
- Tarefas: Desenvolver e implementar pipelines bioinformáticos em ambientes de cloud para análise de dados genómicos.
- Empresa: Centro de Câncer Pancreático Botton-Champalimaud, líder em investigação e inovação.
- Benefícios: Oportunidade de trabalhar com uma equipa multidisciplinar e contribuir para avanços na pesquisa do câncer.
- Outras informações: Ambiente dinâmico com oportunidades de crescimento profissional e colaboração internacional.
- Porquê este emprego: Faça parte de uma missão importante: desenvolver tratamentos eficazes para o câncer pancreático.
- Qualificações: Mestrado em Bioinformática ou áreas relacionadas e experiência em computação em nuvem.
O salário previsto situa-se entre 123750 - 151250 € por ano.
Estamos à procura de 2 bioinformáticos altamente motivados e qualificados para se juntarem à nossa dinâmica equipa de investigação no Centro de Câncer Pancreático Botton-Champalimaud. Os candidatos selecionados desempenharão um papel crítico no desenvolvimento e implementação de pipelines robustos de bioinformática em ambientes de nuvem, analisando conjuntos de dados genómicos complexos e contribuindo para o avanço dos nossos programas de investigação.
Esta posição é ideal para indivíduos com uma forte formação em bioinformática e experiência prática com computação em nuvem e dados biológicos complexos.
Responsabilidades Principais:
- Desenvolvimento e Gestão de Pipelines em Nuvem: Projetar, implementar e manter pipelines escaláveis de bioinformática em ambientes de nuvem (por exemplo, AWS, Azure, GCP) para processamento e análise de dados ômicos em larga escala.
- Análise de Dados Multi-ômicos: Lidar com diversos tipos de dados multi-ômicos, incluindo WGS de câncer, RNA-seq, células únicas, transcriptómica espacial e sequenciação de leitura longa.
- Integração e Visualização de Dados: Integrar dados genómicos com outros conjuntos de dados biológicos relevantes e desenvolver visualizações atraentes para comunicar descobertas complexas.
- Colaboração: Fornecer suporte bioinformático especializado através do nosso departamento de investigação, incluindo biólogos experimentais, clínicos e outros bioinformáticos.
- Documentação e Reprodutibilidade: Garantir documentação rigorosa de todas as análises, código e pipelines para promover a reprodutibilidade e facilitar a transferência de conhecimento.
Requisitos:
- Campo de Investigação: Ciências Biológicas / Ciência da Computação
- Nível de Educação: Mestrado ou equivalente
- Anos de Experiência em Investigação: 1 - 4
Habilidades / Qualificações:
- MSc em Bioinformática, Biologia Computacional, Ciência da Computação ou área relacionada com forte foco computacional.
- Experiência comprovada no desenvolvimento e execução de pipelines de bioinformática em ambientes de computação de alto desempenho (HPC) ou nuvem.
- Experiência prática com software bioinformático para câncer ou genómica humana.
- Fortes habilidades de programação, preferencialmente em Python e/ou R.
- Experiência com sistemas de gestão de workflows (por exemplo, Nextflow).
- Proficiência em sistemas de controle de versão (por exemplo, Git).
- Excelentes habilidades de comunicação escrita e verbal em inglês.
- Uma mentalidade colaborativa e motivação para trabalhar em uma equipe internacional e interdisciplinar.
Qualificações Específicas / Desejáveis:
- Doutoramento em Bioinformática, Biologia Computacional, Genómica, Ciência da Computação ou área relacionada com forte foco computacional ou 3 anos de experiência profissional em um papel semelhante.
- Experiência com tecnologias de containerização (por exemplo, Docker, Singularity).
- Familiaridade com pipelines e ferramentas de análise de dados de sequenciação Nanopore.
- Familiaridade com análise de dados de transcriptómica de células únicas e espaciais.
- Histórico comprovado em conduzir investigação, incluindo o design, execução e interpretação de experimentos.
O processo de seleção incluirá a revisão de todos os CVs e cartas de motivação pela comissão de seleção. Cartas de referência serão solicitadas aos candidatos pré-selecionados, e aqueles considerados particularmente adequados para a posição serão convidados para uma entrevista.
O Centro de Câncer Pancreático Botton-Champalimaud é uma instalação de ponta que compreende laboratórios de pesquisa, um hospital diurno, um centro cirúrgico, bem como instalações de internamento e cuidados intensivos. A missão do Centro é desenvolver novos e eficazes tratamentos para o câncer pancreático.
Empregador para Bioinformatician: Fundação Champalimaud
O Champalimaud Centre for the Unknown é um empregador excecional, oferecendo um ambiente de trabalho vibrante e internacional, ideal para estudantes de doutoramento na interseção da neurociência computacional e engenharia neuromórfica. Os colaboradores têm acesso a oportunidades de crescimento profissional, participando em conferências internacionais e colaborações com instituições de renome, como a ZHAW na Suíça. A cultura de trabalho é colaborativa e interdisciplinar, promovendo a inovação e a criatividade entre os membros da equipa.
Dados de contacto:
Equipa de recrutamento de Fundação Champalimaud
