Knowledge Graph Engineer (Life Sciences) in Porto

Na Capgemini Engineering, trazemos uma equipa global de engenheiros, cientistas e arquitetos para ajudar as empresas mais inovadoras do mundo a libertar o seu potencial. Desde carros autónomos a robôs que salvam vidas, os nossos especialistas em tecnologia digital e software pensam fora da caixa ao fornecer serviços únicos de P&D e engenharia em todas as indústrias. Junte-se a nós para uma carreira cheia de oportunidades, onde pode fazer a diferença.

SUA FUNÇÃO

Você irá construir e manter o conteúdo do grafo de conhecimento científico que será utilizado para responder a perguntas científicas. Você transforma conceitos biológicos em modelos RDF alinhados à ontologia, escreve os pipelines em Python que os geram e mantém cada afirmação rastreável à sua fonte e evidência. Você conecta o significado científico e a entrega técnica, de modo que os ativos do grafo sejam precisos, governados e utilizáveis por aplicações de análise e IA.

Principais responsabilidades

• Desenhar modelos de dados baseados em RDF e estruturas semânticas reutilizáveis para genes, proteínas, doenças, fenótipos, compostos e experimentos.
• Mapear dados estruturados e não estruturados para vocabulários controlados e ontologias.
• Desenvolver pipelines em Python para transformação de dados, resolução de entidades e geração de RDF.
• Definir e validar identificadores, relacionamentos, proveniência e evidência.
• Escrever consultas SPARQL para explorar, testar e analisar grafos de conhecimento.
• Implementar verificações automáticas de qualidade semântica e validação de mapeamento (SHACL ou equivalente).
• Colaborar com cientistas e especialistas em ontologia para resolver questões de terminologia, modelagem e qualidade de dados.
• Documentar regras de mapeamento, decisões de modelagem e regras de validação.
• Apoiar a integração de ativos de grafo em soluções de dados, análise e IA a jusante.

SEU PERFIL

• MSc ou PhD (ou experiência profissional equivalente) em biologia, ciências biomédicas, bioengenharia, genética, neurociência, bioinformática, biologia computacional ou área relacionada.
• 3 a 5 anos de experiência em engenharia de dados, engenharia de software, tecnologias semânticas ou trabalho com dados científicos.
• Fortes habilidades em Python e manipulação de dados, e um comando prático de SQL.
• Modelagem prática de RDF (sujeito, predicado, objeto) e experiência prática com OWL, SPARQL e SHACL, além de RDFS ou lojas de triplas.
• Experiência em projetar mapeamentos de fonte para ontologia ou integrar múltiplas fontes de dados científicos.
• Experiência prática em usar ou desenvolver ontologias, taxonomias, vocabulário controlado ou grafos de conhecimento.
• Compreensão de proveniência, metadados, qualidade de dados e validação de esquema.
• Experiência com conjuntos de dados biológicos ou biomédicos.
• Conhecimento de Git e práticas modernas de desenvolvimento de software.
• Comunicação clara com partes interessadas científicas e técnicas.
• Fluência em inglês.

Qualificações preferenciais

• Experiência prática com Gene Ontology, MONDO, HPO, EFO, UBERON, ChEBI ou outras ontologias do OBO Foundry.
• Bibliotecas da web semântica como RDFLib ou OWLReady2.
• Ligação de entidades, mapeamento de terminologia ou gestão de vocabulário controlado.
• RDF-star, grafos nomeados ou modelagem de grafo de propriedades (Neo4j, GraphDB).
• Conhecimento dos princípios FAIR, governança de metadados científicos e LinkML.
• Experiência em IA agentiva e agentes baseados em LLM, geração aumentada por recuperação, extração de informações ou mapeamento assistido por LLM, com validação da saída.
• Exposição a análises de grafo, similaridade semântica, aprendizado de máquina ou IA generativa.
• APIs, Docker, plataformas em nuvem, orquestração de fluxo de trabalho e pipelines de dados automatizados.
• Experiência em ambiente farmacêutico e de saúde ou outro ambiente regulamentado.
• Fluência em português.

O que procuramos

• Curiosidade científica combinada com disciplina de engenharia.
• Pensamento crítico e atenção à proveniência e qualidade dos dados.
• Conforto com ambiguidade e capacidade de transitar entre significado científico e implementação técnica.
• Uma mentalidade orientada para o impacto em um ambiente dinâmico.

O que você vai adorar em trabalhar aqui

• Junte-se a uma equipe multicultural e inclusiva.
• Aproveite uma atmosfera de apoio que promove o equilíbrio entre vida profissional e pessoal.
• Participe de projetos nacionais e internacionais empolgantes.
• Trabalho híbrido.
• O seu crescimento profissional é central para a nossa missão.
• Programas de formação e certificação.
• Seguro de saúde e vida.
• Programa de referência com bônus por recomendações de talentos.
• Ótimas localizações de escritório.

Sobre a Capgemini

A Capgemini é o parceiro de transformação empresarial para empresas na era da IA. Ajudamos organizações a imaginar e construir um futuro inteligente e sustentável, combinando IA, tecnologia e engenhosidade humana para transformar como operam, inovam e crescem. Com capacidades únicas de ponta a ponta que abrangem estratégia, tecnologia, engenharia e operações inteligentes, reunimos profunda experiência setorial e capacidades líderes de mercado em IA, nuvem e dados para transformar ambições em resultados comerciais mensuráveis em escala. Apoiada por um robusto ecossistema de parceiros e quase 60 anos de experiência, a Capgemini é uma organização global responsável e diversa com mais de 410.000 membros em mais de 50 países.